實際上區塊鏈作為一種新興技術，價值固然存在，但也顯現出了一些劣勢。

　　其一是效率低

　　數據寫入區塊鏈，最少要等待十分鐘，所有節點都同步數據，則需要更多的時間。拿比特幣舉例，當前產生的交易有效性受網絡傳輸影響，比特幣交易每次的確實時間大約10分鐘，6次確認的話需要一個小時。因此區塊鏈的交易數據是有延遲性的。

　　央行周小川行長在2016年初接受專訪時說，目前為止，區塊鏈占用資源還是太多，不管是計算資源還是存儲資源，應對不了現在的交易規模。

　　其二是能耗問題

　　區塊的生成需要礦工進行無數無意義的計算，這是非常耗費能源的。英國一家電力信息網POWER-COMPARE提供的預測數據顯示，按照目前比特幣挖礦、交易耗電量的增長速度，至2020年比特幣耗電量將會與目前全球用電量持平。

　　其三是隱私保護

　　在區塊鏈公有鏈中，每一個參與者都能夠獲得完整的數據備份，所有交易數據都是公開和透明的。如果想知道一些商業機構的帳戶和交易信息，就能知道他的所有財富還有重要資產和商業機密等，隱私保障難。

　　其四是博弈問題

　　區塊鏈的去中心、自治化的特點淡化了國家監管的概念。在監管無法觸達的情況下一些，市場的逐利等特性會導致區塊鏈技術應用于非法領域，為黑色產業提供了庇護所。