從不同角度考慮，主析故障可有不同的分類方法。
（1）根據對微機系統的影響，可將主板故障分為非致命性故障和致命性故障。其中，非致命性故障發生在系統上電自檢期間，一般給出錯誤信息。致命性故障也發生在系統上電自檢期間，一般導致系統死機。
（2）根據影響范圍不同可分為局部故障和全局性故障。
局部性故障指系統某一個或幾個功能運行不正常，如主板上打印控制芯片損壞，僅造成聯機打印不正常，并不影響其他功能；全局性故障往往影響整個系統的正常運行，使其喪失全部功能，例如時鐘發生損壞將使整個系統癱瘓。
（3）根據故障現像是否固定可分為穩定性故障和不穩定性故障。
穩定性故障是由于元器件功能失效、電路斷路和短路引起，其故障現象穩定重復出現；而不穩定性故障往往是由于接觸不良和元器件性能交差，使芯片邏輯功能處于時而正常、時而不正常的臨界狀態而引起的。如由于I/O插槽變形，造成顯示卡與該插槽接觸不良，使顯示呈變化不定的錯誤狀態。
（4）根據影響程度不同可分為獨立性故障和相關性故障。
獨立性故障指完成單一功能的芯片損壞；相關性故障指一個故障與另外一些故障相關聯，故障現象為多方面功能不正常。其故障實質是控制諸功能的共同部分出現故障。例如軟、硬盤子系統工作均不正常，而軟、硬盤控制卡上其功能控制較為分離，故障往往發生在主板上的外設數據傳輸控制即DMA控制電路。
（5）根據故障產生源可分為電源故障、總線故障和元件故障。電源故障包括主板+12V、+5V、+3.3V電源和Power Good信號故障?？偩€故障包括總線本身故障和總線控制權產生的故障。元件故障則包括電阻、電容、集成片及其他元器件的故障。