# -*- coding: utf-8 -*-"""Created on Sat Jun 20 19:36:34 2015@author: chaofn"""import os"""這個程序的目的是將linux下/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb目錄中的所有文件(一共有215個文件)批處理將pdb文件生成dssp文件"""#listdir返回文件名的列表fileLine=os.listdir('/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb')#遍歷整個列表for i in range(len(fileLine)-1): #將字符串用變量表示 input_file='/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb/'+fileLine[i] #先去掉文件名的后綴,然后形成后綴為dssp的文件名 out_file=fileLine[i].split('.')[0]+'.dssp' output_file='/ifs/home/fanchao/Manesh_dssp/'+out_file #注意:參數的傳遞(先是%s,然后是%變量名),多個變量的傳入要用元組表示,在元組前用% os.system('/ifs/share/lib/dssp/dssp2 -i %s -o %s' %(input_file,output_file))
新聞熱點
疑難解答