ChemOffice 15的三個組件均可三維旋轉分子結構中的某一子結構，以下圖為例具體講解操作方法：首先，繪制并選中需要旋轉的結構;然后單擊ChemDraw化學工具主工具欄的“Structure Perspective”旋轉工具圖標，拖拉矩形框選擇右邊苯環;此時將鼠標移到選框中，當光標變為手形時上下拖拉可旋轉右邊苯環。在ChemDraw PRime 15屏幕上同時顯示旋轉的角度。在旋轉分子結構的局部時旋轉方向有一定限制，如果使用者想旋轉的是整個分子結構可以分別圍繞X、Y軸進行旋轉，不受方向限制。

　　溫馨提示：使用Structure Perspective旋轉工具旋轉和使用選擇框的旋轉柄旋轉是兩種不同的效果，旋轉工具是旋轉分子結構本身所在的維度，相當于三維動態演示分子結構，而選擇是在位置上旋轉分子結構，結構本身并不會發生變化。