Windows查找文件時要訪問文件分配表(FAT)，它可以通過儲存已訪問的文件的路徑和名字來加快下一次訪問的速度。如果設置為便攜機，系統只能存儲16個文件夾和337個文件，使用約4KB內存;設置為臺式機，那么系統能存儲已訪問過的32個文件夾和677個文件，使用約10KB的內存;而設置為網絡服務器可以存儲高達64個文件夾和2729個文件，使用約40KB的內存。所以將系統設置為網絡服務器可以大幅度提高FAT存儲能力加快訪問速度。Windows優化大師針對不同的用戶類型為使用者提供了7種文件系統優化方式。其中包括：Windows標準用戶適用于Windows的所有沒有特殊需求的用戶;電腦游戲愛好者用戶適用于經常玩CS等3D游戲的用戶;系統資源緊張用戶適用于開機后系統資源可用空間較小的用戶;多媒體愛好者適用于經常運行多媒體程序的用戶;大型軟件用戶適用于經常同時運行幾個大型程序的用戶;光盤刻錄機用戶適用于經常進行光盤刻錄的用戶;錄音設備用戶適用于經常進行音頻錄制和轉換的用戶。

　　二級數據高級緩存：中央處理器(CPU)的處理速度要遠大于內存的存取速度，而內存又要比硬盤快得多，這樣CPU與內存之間就形成了影響性能的瓶頸。CPU為了能夠迅速從內存獲取處理數據設置了緩沖機制：二級緩存(L2 Cache)。Windows 2000/XP/2003系統在從中央處理器(CPU)的二級緩存(L2 Cache)讀取數據失敗后，還會通過操作系統設置的二級數據緩存中讀取數據。調整這個選項能夠使Windows2000/XP/2003/Vista更好地配合CPU并充分利用操作系統的SecondLevelDataCache機制獲得更高的數據預讀命中率。然而，讓操作系統設置多大的緩沖區取決于用戶的CPU(Windows2000/XP/2003/Vista操作系統默認二級數據高級緩存的大小為256 KB)。Windows優化大師能夠自動檢測用戶的CPU并推薦最適合當前系統的緩存大小，現在使用者只需移動調節棒到推薦位置即可。

　　優化NTFS性能，禁止更新最近訪問日期標記。當Windows2000/XP/2003/Vista訪問一個位于NTFS卷上的目錄時，會更新其檢測到的每一個目錄的最近訪問日期標記。這樣如果存在大量的目錄將會影響系統的性能。使用此選項將禁止操作系統更新目錄的最近訪問日期標記，以達到提高系統速度的目的。注意：如果使用者的文件系統不是NTFS時選擇此項不會提高文件系統性能。建議使用NTFS文件系統的Windows2000/XP/2003用戶選擇此項。

　　優化NTFS性能，禁止創建MS-DOS兼容的8.3文件名。在NTFS分區上創建MS_DOS兼容的8.3格式文件名將會影響NTFS文件系統的速度，建議使用NTFS文件系統的Windows2000/XP/2003/Vista用戶選擇此項。注意：啟用此項后，部分16位程序在安裝時可能出現無法創建諸如“c:progra~1applic~1”目錄名的問題，這時候用戶可以通過重新啟用此功能來解決。同時啟用該項目后Symantec的部分企業版軟件可能出現無法安裝的情況，例如：Symantec Anti-Virus，此時關閉此選項即可。

　　修改完成后，點擊“優化”，進行保存設置。

　　設置向導：

　　點擊“設置向導”，Windows優化大師幫助您完成對文件系統的優化設置。

　　進入文件系統優化向導，點擊“下一步”，開始文件系統優化設置。

　　您可以根據您使用計算機的情況做出選擇，可以選擇“最高性能設置”(默認)，也可以選擇“最佳多媒體設置”，點擊“下一步”

　　優化大師根據您上一步的選擇，自動生成最佳的優化方案，點擊“下一步”

　　在文件系統優化完成之前，優化大師將提示您“是否進行文件系統優化”，點擊“完成”，便進行文件系統的優化。

　　恢復：

　　將文件系統優化設置恢復到Windows默認設置，點擊“恢復”