PE系統下安裝軟件也不同于普通Windows系統，在運行綠色軟件(非集成在PE里的)，大部分情況下會出錯，提示找不到xxx文件(一般是dll文件)。碰到這種問題時候需要找到自己的系統文件夾(比如C:WINDOWSsystem32或C:WINDOWS)搜索找到這個文件，再把它復制到與你軟件相同的目錄下 重新運行即可(可能會提示多次哦)。大部分情況下可以解決問題。

　　如果你是在安裝軟件時提示找不到xxx文件，這時候就不可以采取上面的方法了，因為PE系統只集成了windows運行的核心應用，因此將缺少的文件復制到與你軟件相同的目錄下重新安裝成功率不高。若想要解決這個問題則需要另一種辦法了。

　　運行軟件時，PE會先從軟件的同一目錄下尋找所需文件，然后是PE系統的。而因為PE只包含了系統的核心文件，不能保證有所需文件。解決方法之一就是在這兩步搜索之后讓其自動搜索原系統的系統文件夾(比如C:WINDOWSsystem32或C:WINDOWS)。這樣就很智能了，免去了不少麻煩。

　　關于綠色軟件的運行、非綠色軟件安裝的其他問題也可以考慮采用這種“嫁接”的思路解決，因為原系統是健全的，解決問題的幾率會大些。簡而言之，將PE系統“嫁接”于原系統。